Atatürk Üniversitesi Eğitim Bilimleri Enstitüsü, Bakanlar Kurulu’nun 01/02/2010 tarihinde almış olduğu karar ve bu kararın 26.02.2010 tarih 27505 sayılı Resmi Gazete’de yayınlanmasıyla kurulmuştur Atatürk Üniversitesi bünyesindeki lisansüstü öğrencilerin eğitimi 2010 yılına kadar Sosyal Bilimler ve Fen Bilimleri Enstitüleri tarafından yürütülmekteydi. Yukarıda bahsedilen tarihten itibaren, 01/07/2010 tarihinde yapılan Yükseköğretim Genel Kurulu toplantısı ile “Lisansüstü Eğitim-Öğretim Enstitülerinin Teşkilat ve İşleyiş Yönetmeliği”nin 4. ve 7. maddeleri uyarınca, Sosyal ve Fen Bilimleri Enstitüsü bünyesinde lisansüstü etkinlikleri sürdürülen Atatürk Üniversitesi Kazım Karabekir Eğitim Fakültesi’ne bağlı tüm Ana Bilim Dalları ve Bilim Dallarının, Yükseköğretim Kurulunun 13/07/2010 tarih ve 23699 sayılı yazıları doğrultusunda Eğitim Bilimleri Enstitüsü’ne aktarılması uygun görülmüştür. Bu karar doğrultusunda, enstitümüze devredilen bilim dallarında yapılan tüm lisansüstü etkinliklerde ve eğitim alanında yapılan tüm tezlerde belirli bir ulusal ve uluslararası standardın yakalanması amaçlanmıştır.